1. I tak źle...
Bruce odkrywa więcej sekretów swojego niedawno zmarłego ojca. Gordon niechętnie przystaje na współpracę z Oswaldem Cobblepotem.
James Gordon rozpoczyna pracę w policji miasta Gotham City. Mężczyzna wraz ze partnerem Harveyem Bullockiem otrzymuje sprawę morderstwa zamożnego małżeństwa. Gdy dociera na miejsce zbrodni, detektyw poznaje nastoletniego syna ofiar Bruce’a Wayne'a będącego światkiem zdarzenia. Wstrząśnięty sytuacją chłopca James decyduje się za wszelką cenę odnaleźć mordercę jego rodziców.
Bruce odkrywa więcej sekretów swojego niedawno zmarłego ojca. Gordon niechętnie przystaje na współpracę z Oswaldem Cobblepotem.
Gordon przewodzi operacji odnalezienia uciekinierów z Arkham, którzy nadal są na wolności. Tymczasem Alfred, chcąc bronić Bruce’a, decyduje się na drastyczny krok.
Alfred przekonuje Bruce’a, by wziął udział w zbiórce dla Szpitala Dziecięcego. Sprawy niespodziewanie przybierają złowrogi obrót.
Tragedia w dziale prowadzi do awansu Gordona i jeszcze większego poświęcenia w walce ze złem. Theo Galavan prezentuje swoje plany dotyczące przyszłości Gotham.
Kiedy Pingwin i Galavan zawierają sojusz z rodziną podpalaczy, przestępczość w Gotham gwałtownie rośnie. Pomiędzy rodzinami Galavan a Wayne odżywa konflikt sprzed lat.
Rozdarta wewnętrznie Bridgit rozważa swoje opcje. Tymczasem Pingwin i Galavan nie ustają w pojedynkach o przejęcie władzy.
Żądny zemsty Pingwin nie cofnie się przed niczym, aby uwolnić swoją matkę. Podczas pierwszego spotkania Silver i Seliny dochodzi do sprzeczki z powodu Bruce’a.
Barbara wybudza się z przerażającego koszmaru. Żądny władzy Galavan przedstawia Bruce’owi ofertę, której trudno nie przyjąć.
Lee wyraża swój niepokój wobec ciemnej strony Gordona. Edward opiekuje się zranionym Pingwinem i prosi go o radę.
Selina i Bruce odnawiają swój sojusz. Tymczasem Gordon na nowo podejmuje walkę o to, by Galavan siedział za kratkami.
Po porwaniu Bruce’a Gordon zwraca się do zaskakującego sprzymierzeńca, aby przeszkodzić Galavanowi w jego planie zemsty na rodzinie Wayne’ów.
Gordon przygotowuje się do ważnego zeznania. Tymczasem w Gotham pojawia się nowy, przerażający przestępca, który zamraża ludzi na śmierć.
Alfred dzieli się nowymi informacjami o człowieku, który zabił rodziców Bruce’a. Policja przygotowuje wprowadzenie nowego pacjenta do Szpitala Psychiatrycznego Arkham.
Pingwin kontynuuje swoją terapię z Hugo Strange’em, który wierzy, że może „wyleczyć” pacjenta z agresji. Bruce na nowo poprzysięga, że odnajdzie mordercę rodziców.
Gordon i Bullock prowadzą dochodzenie w sprawie rabunku w muzeum. Pingwin nadrabia zaległości ze starymi znajomymi. Bruce testuje swój uliczny spryt.
Gordon poznaje smak więziennego życia. Bullock przynosi druzgocące wieści. Tymczasem Pingwin musi poradzić sobie z rodzinną dysfunkcją.
Zdesperowany Gordon stara się oczyścić swoje dobre imię. Tymczasem Pingwin poznaje zaskakującą prawdę o śmierci swojego ojca.
Barbara kontaktuje się z Gordonem, próbując naprawić ich wzajemne relacje. Bruce i Alfred rozpoczynają poszukiwania jednego ze starych współpracowników Thomasa Wayne’a.
Podczas gdy Gordon wypytuje profesora Strange'a o jego pracę w Pinewood Farms, nowy złoczyńca przygotowuje atak na miasto.
Przysięga Azraela, że zabije Gordona, wywabia Pingwina z kryjówki. Nowym celem ataku bardzo szybko zostaje Bruce.
Bruce, Gordon, Lucius i Alfred wyruszają na ratunek Selinie — najpierw muszą odnaleźć sekretne laboratorium profesora Strange’a.
W czeluści laboratorium profesora Strange’a Gordon przechodzi chemiczną transformację. Tymczasem miastu Gotham grozi nowe niebezpieczeństwo.