1. Rok zerowy
Starzy złoczyńcy zaznaczają swoją obecność w chaotycznym Gotham, gdzie Gordon i Bruce walczą o bezpieczeństwo miasta, a Selina staje przed niepewną przyszłością.
Ostatni sezon serialu przedstawia ostateczny upadek miasta Gotham. Bohaterowie i złoczyńcy walczą o przetrwanie, a Bruce Wayne zbliża się do wypełnienia przeznaczenia.
Starzy złoczyńcy zaznaczają swoją obecność w chaotycznym Gotham, gdzie Gordon i Bruce walczą o bezpieczeństwo miasta, a Selina staje przed niepewną przyszłością.
Podczas gdy Bruce szuka tak zwanej czarownicy, Gordon i Bullock podążają tropem prowadzącym do fabryki pełnej zaginionych dzieci. W innym miejscu Nygma zmaga się z własnymi demonami.
Istnieje bezpieczne miejsce dla uchodźców z Gotham – dopóki Pingwin nie przybędzie, aby zabrać swoich ludzi. Zdeterminowana Selina prosi Bruce'a o pomoc w odnalezieniu Jeremiasza.
W następstwie wybuchowego ataku Pingwin oferuje Gordonowi swoją pomoc, a Lucius i Nygma zawierają umowę. Tymczasem Selina zawęża zakres poszukiwań.
Do Gotham przybywa wojskowa grupa zadaniowa, aby pomóc przywrócić porządek. Poszukiwania odpowiedzi prowadzą Nygmę do Pingwina i ponownego spotkania z Hugo Strange'em.
To wojna nieoczekiwanych sojuszy, w której Gordon zbiera drużynę, aby odzyskać Gotham. Przebiegły nowy złoczyńca nie daje spokoju Pingwinowi i Selinie.
Gordon stara się zdemaskować przestępczą organizację, która zagraża ponownemu zjednoczeniu Gotham. Znany złoczyńca powraca z pomocą Szalonego Kapelusznika.
Zmieniający kształt złoczyńca, który atakuje policjantów z Gotham, łączy Bullocka z duchami z jego przeszłości. Bruce i Alfred badają kanały ściekowe miasta.
Dotknięty tragedią Gordon pogrąża się w gorączkowym śnie, stając przed sądem za serię niepowodzeń. W teraźniejszości Ivy powraca i zwraca uwagę na Bruce'a.
Bruce i Gordon stają twarzą w twarz z Eduardo, który przeszedł ogromną przemianę. Ciężarna Barbara zwraca się o pomoc do Lee.
Gdy Bane i Nyssa zacieśniają kontrolę nad miastem, Gordon zwraca się do swoich dawnych wrogów o pomoc w jego ocaleniu. Ważna decyzja kieruje Bruce'a ku jego przeznaczeniu.
Dziesięć lat po opuszczeniu Gotham Bruce powraca na otwarcie nowego Wayne Tower, aby odkryć mroczne miasto potrzebujące rycerza.