Sam Flynn zostaje wciągnięty do wirtualnego świata, tworzonego przed lata przez swojego zaginionego ojca. Odtąd musi walczyć o przetrwanie w cyfrowej rzeczywistości.
Logan i Victor zostają zwerbowani przez pułkownika Strykera do wykonywania niecodziennych misji. Wolverine, widząc okrucieństwo, jakiego dopuszczają się pozostali najemnicy, odchodzi z jednostki.